Мат. капитал надо (можно) использовать, если Вы покупаете квартиру надолго (планируете в ней жить), не для инвестиций. После использования мат. капитала необходимо всех членов семьи наделить долями (в том числе и детей), и для продажи данной квартиры нужно будет получить разрешение опеки для продажи, что усложняет продажу квартиры и уменьшает цену продаваемой недвижимости.

Если Вы не знаете: будете продавать квартиру в ближайшее время или нет, то лучше оставить мат. капитал на обучение детей, пенсию мамы и т. д.